پژوهشکده علوم تولید مثل رویان از ابتدای تاسیس پژوهشگاه رویان در خردادماه ۱۳۷۰ فعالیت خود را با چند گروه پژوهشی آغاز کرد. لذا قدیمی‌ترین پژوهشکده رویان محسوب می‌شود.
این پژوهشکده در زمینه افزایش میزان باروری، سلامت جنین و بهبود سلامت جامعه در حوزه‌های متنوع علوم تولیدمثل فعالیت دارد و هم‌اکنون دارای شش گروه پژوهشی است.
